Сезон 1 - "Indigo League (Лига Индиго)"

В горах Эш тренируется к Лиге Покемонов, сражаясь с Вульпиксом Брока. Пикачу хочет использовать молнию, а Вульпикс огненную атаку. Но между ними прыгает Джиглипуфф. Они говорят своим покемонам быть поосторожнее и прыгают в щель между скалами. Происходит взрыв. Когда пыль рассеивается, то Эш и его друзья видят, что они обнаружили нечто иное, как храм. Брок поднимпет камень и видит какой-то древний предмет. Вдруг кто-то выхватывает его из рук. Друзья видят группу археологов, которые прибежали на звук взрыва. Молодая женщина показывает предмет некому «Профессору» и говорит, что это только доказывает её гипотезу. Броку нравится эта женщина. Её зовут Иви, и она слишком увлечена находкой. Друзья совсем не понимают, о чём разговаривают Иви и Профессор.

На вершине скалы Команда R смотрит на всё, что происходит через бинокль. Теперь их замысел – похитить несколько ценных находок из храма. Иви приглашает Эша и Мисти в трейлер, и там они видят стол, а на нём ложка и только что найденная ими вещь. Мисти говорит, что она читала о том, что древние люди строили храмы в честь покемонов. На вопрос Эша, как назывался город, который они ищут. Иви ответила, что это был Покемополис, и он был уничтожен штормом, а потом вовсе исчез. Брок рассказывает, что древние люди верили в то, что покемоны были символами сил природы, а потом добавляет, что это может быть и есть Покемополис. Иви надеется, что так оно и есть. Вдруг вбегает Профессор, называя Иви доктором и говоря, что ложка летала вокруг найденного предмета. Иви считает, что это может быть ключ к двум силам разрушения. Эш спрашивает, почему Профессор назвал её доктором. Тот отвечает, что степень доктора она получила в восемь лет. А Мисти говорит, что в восемь лет она всё ещё боялась докторов. Доктор Иви покрутила ложку около другого предмета, но только Пикачу заметил, что предмет засветился.

Иви достаёт плитку, а Мисти спрашивает, что на ней написано. Доктор отвечает, что существуют две разрушительные силы: два покемона. Эти два покемона будут сражаться и сносить города. Никто не знает, что может заставить их вернуться в мир теней. Иви говорит, что она собирается всё выяснить. Брок её поддерживает. В то же время за ними наблюдает Команда R. Мяут вслух мечтает, как было бы хорошо, если бы люди поклонялись покемонам. Он прыгает на Джесси и Джеймса и приказывает им ему подчиняться, но потом платится за это.

В ту ночь, когда все уснули, находка, обнаруженная Броком начинает светиться. Команда R тайно проникает в лагерь. Джесси посылает Эрбока принести всё ценное, что он заметит в храме. Через несколько минут покемон возвращается с чёрным предметом в зубах. Джесси разочарована – эта вещь скучна. Но вдруг предмет начинает светиться, и Эрбок исчезает. Предмет поднимается в воздух, будто бы за ним следует огромное существо. Оно приближается, и Команда R в ужасе ожидает, что же с ними будет.

На следующий день все видят следы на земле, ведущие от храма. Профессор заметил чёрный предмет и поднял его, говоря, что это может быть чёрной силой, упомянутой на плитке. Предмет снова начинает светиться, и Профессор исчезает. Наружу высвечиваются все, кто был пойман, и Эш замечает Команду R. Все в панике убегают, но рабочие застывают на месте и тоже исчезают. Эш и остальные бегут в трейлер. Там всё летает. Ложка начинает летать вокруг другого предмета, и появляется огромный Генгар. Эш напоминает, что Генгар, которого он видел до этого, был даже меньше, чем он сам. Генгар поднимает руки к небу, оно темнеет. Потом огромный покемон начал двигаться в направлении Алабастии. Мисти говорит, что он, должно быть, хочет уничтожить город, и Эш побежал за ним. Мисти и Брок последовали за Эшем, говоря Доктору Иви решить загадку Покемополиса.

Эш и его друзья подбегают к Генгару. Брок посылает Оникса, а Эш - Пиджиотто. Пиджиотто использует вихревую атаку, но исчезает. Оникс тоже исчезает. Генгар поворачивается и замечает троих друзей, они начинают бежать обратно к трейлеру. В трейлере они находят Иви, которая летает в воздухе, держа ложку в руках. Ложка выглядит словно ключ к предмету, найденному Броком. Потом трейлер заполняется светом, и все падают на землю.

Другой огромный покемон появляется – это Алаказам. Алаказам и Генгар начинают сражение. Это выглядит прямо, как описание на плите. Эти два покемона уничтожили Покемополис. Эш бросает покеболл, но Алаказам и Генгар взрывают его. Эш, Мисти, Брок и Иви парализованы. Только Пикачу удалось сбежать. Он прыгает в воду и использует молнию. Покемоны и все остальные внутри Генгара тоже испытывают шок, однако Эш и его друзья освобождаются от атаки, которая их парализовала.

Теперь Генгар и Алаказам действительно очень злы. На скале появляется Джиглипуфф. Он падает ко всем остальным. Брок считает, что если Джиглипуфф запоёт, то Алаказам и Генгар уснут. Однако, когда Джиглипуфф начинает петь, с ними ничего не проиходит. Они слишком большие. Вдруг появляется огромный Джиглипуфф. Он тоже начинает петь. Эш и его друзья засыпают. То же случается и с Генгаром и Алаказамом. Джиглипуфф, заметив, что все уснули, разрисовывает лица Генгара и Алаказама. Небо расчищается.

Позже все просыпаются. Команда R, ощущая себя на воле, радуются, хотя говорят Эшу, что они ещё украдут Пикачу и убегают. Мисти спрашивает Иви, что случилось с огромными покемонами, на что получает ответ, что они вернулись туда, откуда пришли. Брок предполагает, что Джиглипуфф был защитником Покемополиса, а Иви, что эти два предмета могли быть древними покеболлами. Доктор также говорит, что, возможно, они разгадали тайну Покемополиса